Parmi les premiers en gynécologie médicale, en médecine physique et de réadaptation ou en
rhumato, et classé 9e en médecine générale, le CHU arrive en revanche dans les derniers en néphrologie, ophtalmologie, biologie, endocrinologie, gynécologie-obstétrique.
Le résultat moyen au classement général du CHU de Brest s’explique donc par une forte disparité de ses spécialités, qui oscillent entre les plus et les moins plébiscitées par les jeunes médecins.